基因敲除小鼠计划(KOMP)是一项跨NIH计划,旨在与国际基因敲除小鼠联盟(IKMC)的其他成员一起,产生一种小鼠胚胎干细胞的公共资源,该细胞包含小鼠基因组中每个基因的零突变。通过使用两种互补的靶向策略,KOMP产生了条件突变和无效突变。
KOMP研究网络
敲除胚胎干细胞和基因敲除小鼠的KOMP生产中心--CSD(CHORI-Sanger-UCDavis)。CSD是奥克兰儿童医院研究所(CHORI)、威康信托桑格研究所和加州大学戴维斯兽医学院的合作团队,由CHORI博士Pieter deJong、K.C.Kent Lloyd、D.V.M.博士、UC Davis和Allan Bradley博士以及William Skarnes博士领导威康信托桑格研究所;Regeneron Pharmaceuticals,Inc.的VelociGene部门的一个团队,由David Valenzuela博士和George D.Yancopoulos博士领导。
以杰克逊实验室为中心的KOMP数据协调中心。由Martin Ringwald博士、Jim Kadin博士、Janan Eppig博士和Carol Bult博士领导。
KOMP知识库是加利福尼亚大学戴维斯兽医学院和奥克兰儿童医院研究所(CHORI)的合作项目,由K.C.Kent Lloyd,D.V.M.,Ph.D.,UC Davis和Pieter deJong,Ph.D.,CHORI.领导。;
由Klaus Kaestner博士、宾夕法尼亚大学博士、Andras Nagy博士、西奈山医院Samuel Lunenfeld研究所和Regeneron Pharmaceuticals,Inc.领导的研究小组,他们开发了提高产生敲除C57BL/6 ES细胞系效率的方法。
KOMP研究网络从以下方面获得指导:
NIH KOMP工作组,由支持KOMP计划的每个NIH研究所的项目人员组成。
负责审查和评估KOMP研究网络成员进展的科学顾问小组
KOMP生产渠道中的角色和数据流
KOMP数据协调中心(KOMP-DCC)是协调KOMP内小鼠基因定位的中心数据库资源。国立卫生研究院的KOMP管理人员利用DCC提供的数据和工具,对用于基因敲除实验的小鼠新基因进行优先排序,并将其分配给KOMP生产中心。DCC跟踪淘汰生产管道的进度,收集、标准化和整合KOMP数据,并将数据提供给所有KOMP参与者。DCC还充当KOMP的中央公共接口,并为KOMP数据提供基于web的查询和显示工具。此外,该网站还为科学界提供了一个工具,以提名将被KOMP淘汰的感兴趣基因。利用互补的靶向策略,两个KOMP生产中心CSD和Regeneron设计并创建靶向载体、突变ES细胞系以及在某种程度上突变小鼠、胚胎或精子,并将这些材料转移到KOMP储存库。KOMP存储库存档、维护和分发KOMP产品。研究人员可以订购产品并从存储库中获取产品信息。研究人员还可以表达对仍在研发中的产品的兴趣。一旦这些KOMP产品可供分销,他们就会收到电子邮件通知。
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